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首款国产固相育种芯片“华麦芯65K”发布

类别:科技 发布时间:2024-05-15 06:22:00 来源:每日看点快看

本文转自:农民日报

庞斌双刘丽华农民日报·中国农网记者芦晓春

近日,国内首款具备完全自主知识产权的高密度固相小麦育种芯片——“华麦芯”普通小麦基因分型65K芯片(简称“华麦芯65K”)发布,由北京市农林科学院杂交小麦研究所种子检测研究室(“北京小麦种子检测中心”)牵头联合苏州拉索生物芯片科技有限公司、中国农业大学、西北农林科技大学等单位研发。这一突破性品种对提升我国小麦品种创新、知识产权保护和种子质量控制具有重要意义。

据悉,“华麦芯65K”严格遵照《小麦品种真实性鉴定SNP标记法》(NY/T4021-2021),囊括真实性鉴定和已知品种高密度指纹数据库构建的所有位点,并整合转基因检测所必需的特定标记物,以及部分与小麦产量、品质、抗病等功能基因或紧密连锁的SNP标记。以中国春2.1版本为参考,目前包含54993个精选的SNP标记(可根据未来研究重要结果扩充至65K),覆盖196个性状相关标记。SNP位点在A、B、D染色体上分布较均衡,多态性位点占比高达99.1%,具备良好的区分能力和稳定性;单个SNP位点采用15~30个微球重复检测,平均检出率高达99.0%,再现性高达99.5%。

“华麦芯65K”具有五个突出优势:一是全自主。从芯片制备到扫描仪、试剂、配套软件及算法在内的一体化解决方案均可自主实现。二是可扩充。可根据需要在原有芯片基础上随时添加新的检测位点,无需重新定制新的芯片,灵活性高、可塑性强。三是多效用。该芯片集背景筛选、品种鉴定、转基因检测等多用途于一体,可实现一站式全面筛查,大幅提高检测效率,并节约成本。四是低成本。固相芯片在规模化检测时展现出显著的成本效益。随着样本数量增加,单个样本的检测成本呈下降趋势,经济效益明显。五是高效率。固相芯片以固态基底上的寡核苷酸探针为基础,无需依赖测序或其他基因分型技术,即可一次性并行检测数十万至数百万个SNP位点,从检测到数据分析,整个过程仅需72小时,且准确率保持在99%以上。24个样本即可完成检测,无需凑样。

该芯片的成功研发,有效解决了国外固相芯片技术垄断“卡脖子”问题,实现了我国高密度固相育种芯片从0到1的突破,将为我国小麦育种创新发展提供重要支撑。

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快照生成时间:2024-05-15 08:45:09

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