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...取得了前所未有的突破，但依旧无法胜任蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）这种复杂的任务。初创公司A-Alpha Bio的PPI数据集AlphaSeq，有望补足这方面的技术短板。随着最近AlphaFold 3和ESM 3的相继推出，我们看到了深度学习在生物学领域...……更多
2024-08-27 13:32:00相互作用,蛋白质,蛋白,模型,作用,数据
...嵌套结构的设计逻辑，能够对单个蛋白质、细胞中蛋白质相互作用、细胞本身，以及细胞系统建模。
以下是在百图生科交流会访谈实录基础上，经整理、编辑而成：01 生命科学领域AI大模型的用武之地 尽管一款新药的成功研发...……更多
2023-03-15 09:26:00科学,生命科学,首席,科学家,药物,模型
...型AlphaFold3，能以较高准确率预测蛋白质与其他生物分子相互作用的结构，其准确率比之前的专用工具显著提升。AlphaFold3能预测含有蛋白质数据银行(Protein Data Bank)内几乎所有分子类型的复合物的结构。这个最新迭代模型用计算机...……更多
2024-05-09 11:54:00迭代,准确率,人工智能,药物,人工,模型
...于此。科学家们正努力将AI的力量拓展至动态表征和分子相互作用的模拟领域。最近，微软研究院开发的AI²BMD（AI-basedabinitiobiomoleculardynamics system，基于AI的从头算生物分子动力学系统）在Nature上发表，这一进展代表着在分子动力...……更多
2024-11-08 09:42:00里程,微软,领衔,里程碑,分子,突破
...aFold3是一款革命性的系统。对于蛋白质与其他分子类型的相互作用，AlphaFold3在基准测试中的准确率比现有最好的传统方法高出50%，且无需输入任何结构信息，这使得AlphaFold3成为首个在生物分子结构预测方面超越基于物理工具的...……更多
2024-05-12 23:11:00准确率,自然,杂志,结构,蛋白质,蛋白
...为一个细胞的。我们也不知道体内的多种细胞类型是如何相互作用的。对于细胞、组织和器官如何产生疾病以及它们如何保持健康，我们的理解有限。然而，如果研究人员能够获取并利用人工智能强大的新技术，那么可以辅助回...……更多
2023-12-21 07:04:00人工智能,人工,细胞,辅助,原理,疾病
...白质分子设计。当具有能力可以设计蛋白质分子及分子间相互作用，我们也同时具有能力，可以从头设计生命体内的物质结构与信号传递，有望实现生命从头设计。可以预期AI大模型辅助的蛋白质的可编程从头设计，我们将以前...……更多
2023-12-25 05:45:00从头,生成,模型,生命,设计,蛋白质
...疫反应，人体的每一个生物过程都依赖于蛋白质的之间的相互作用。蛋白质的结合具有一个重要性质——特异性，就像钥匙和锁。「锁齿」对不上，蛋白质就无法结合并发挥作用。
关于这类过程的原理和机制，AlphaFold等结构预...……更多
2024-09-07 09:49:00蛋白,亲和力,蛋白质,癌症,设计,蛋白
...测了所有生命分子（蛋白质、DNA、RNA、配体等）的结构和相互作用。与现有的预测方法相比，AlphaFold 3 发现蛋白质与其他分子类型的相互作用至少提高了 50%，对于一些重要的相互作用类别，预测准确率甚至提高了一倍。研究团...……更多
2024-10-09 18:37:00诺贝尔化学奖,诺贝,开发者,科学家,荣誉,科学
...位置的能力，能够更全面地揭示蛋白质和核酸与其他分子相互作用时的灵活性。传统方法需要使用刚性蛋白质结构和对接方法来预测蛋白质—配体结构，而新一代模型无需这些先验信息，反而表现出更高准确性。可以说，其重新...……更多
2023-11-06 03:06:00新一代“阿尔法折叠”登场
...模型让他们确定了一种蛋白质，它能在DNA转录过程中与DNA相互作用，并引导DNA进入酶的活性位点。另一种成分可以与正在产生的 mRNA 相互作用，从而在 mRNA 转化为蛋白质之前保护它不被蛋白质降解。韦伯斯特博士说：\"我们知道...……更多
2024-03-14 10:30:00光合,光合作用,原子,科学家,作用,秘密
...结构预测还有很大的探索空间，例如蛋白质与其他分子的相互作用、单点突变对蛋白质结构和功能的影响、孤儿蛋白质结构预测、蛋白质侧链预测等。因此，仅AI蛋白质结构预测领域，在AlphaFold 2出现后就仍然不断有前沿成果涌...……更多
2024-09-18 15:04:00流光,蛋白质,漫游,蛋白,宇宙,生命
...尔法折叠3通过准确预测蛋白质、DNA的结构以及它们如何相互作用，改变了人们对生物世界和药物发现的理解。图片来源：深度思维/Isomorphic Labs科技日报北京5月8日电 （记者张梦然）《自然》8日报道了结构生物学最新进展——阿...……更多
2024-05-09 05:58:00阿尔法,阿尔,阿尔法,阿尔,蛋白质,蛋白
...限。生成式AI要面临的挑战和机会在于对PPI（蛋白之间的相互作用）的数据集。我们预期需要由新一代的结构生物学平台去生成，或是像诺和诺德 、辉瑞这类大公司能够公开已有的实验室结构蛋白及一些基础的数据库，全世界的...……更多
2023-02-22 08:00:00里来,新药研发,新药,高质量,数据,蛋白
...模型的底层模型上。这些模型正在提高其预测药物性质和相互作用的能力。为了帮助实现这一潜力，英伟达开发了BioNeMo，这是一种用于生物学中的生成式AI的云服务，为小分子和蛋白质提供了各种AI模型。科斯塔断言，有了BioNeMo...……更多
2024-02-05 02:03:00药物,前景,检验,实践,药物,诺夫
...里程碑，能以前所未有的精度预测所有生命分子的结构和相互作用，为科学家们提供了一个强大的工具，以更精确地理解疾病机制并开发新的治疗药物。具体来说，AlphaFold 3不仅可以预测蛋白质的结构，还可以预测几乎所有生命...……更多
2024-05-10 16:08:00强势,科学家,进步,人类,科学,蛋白
...子也好比一个个天体，可以借助物理模型计算它们之间的相互作用。由此带来两方面好处：第一、相较于传统结构生物学实验方法，这种利用AI的方法能够动态还原分子作用的过程。X射线衍射、冷冻电镜等实验手段能做到的还只...……更多
2024-08-09 09:38:00糖尿,中国,糖尿病,药物,辅助,团队
...点是了解基因及其产物(蛋白质)在基因组背景下的作用、相互作用和功能。它旨在描述全基因组范围内的基因功能和相互作用。在基因组中寻找线索，以了解与炎症、抗氧化剂、消化、I期和II期解毒途径等相关的通路中是否存在...……更多
2024-01-04 14:11:00鲍勃,米勒,功能性,基因,家人,医生
...正常运转，细胞内蛋白质和其他分子之间会发生数十亿次相互作用。但是，当相互作用的反应过程发生病变时，蛋白质就会聚集成团块并且进一步恶化，从而导致阿尔茨海默症等神经疾病。哥本哈根大学的研究人员开发了一种AI...……更多
2024-07-22 09:40:00阿尔茨海默,剑桥大学,阿尔,剑桥,准确率,临床
...发的AI工具MatchMaker，以预测蛋白质组水平上小分子之间的相互作用。除上述工具外，预测蛋白质结构“赛道”上的另一位“网红”RoseTTAFold也不容小觑。其由华盛顿大学蛋白质设计研究所科学家主导开发，能“绘制”或“想象”...……更多
2023-10-10 03:51:00阿尔法,新发,阿尔,药物,蛋白质,阿尔法
...建峰也说，希望未来能开发出新药，与研究中确定的蛋白相互作用。尽管上述研究结果让人们对痴呆的早期诊断和尽早治疗燃起新的希望，但也有研究人员强调，新发现的这些标志物还需进一步验证，才能作为临床筛查工具。“...……更多
2024-02-29 02:03:00蛋白质,蛋白,风险,分析,血液,研究
...个蛋白质由一系列氨基酸组成，氨基酸与外部环境之间的相互作用决定了蛋白质的“折叠”，这决定了其最终的形状。对于生物技术公司来说，能够根据其氨基酸序列预测蛋白质形状非常重要，这些公司可以利用这些预测来设计...……更多
2024-03-18 11:59:00英伟,重头戏,赛道,重头,认证,黄金
...系列化学信号的引导下到达卵子，然后通过特定的蛋白质相互作用与卵子的表面结合。这种结合使精子和卵子的细胞膜融合，并且使彼此的遗传物质融合形成受精卵——一个最终会长成新生命的单细胞。斑马鱼的精子进入一个可...……更多
2024-10-24 22:14:00卵子,精子,精子,卵子,蛋白质,蛋白
...，实现了从单链蛋白质结构预测到所有生命分子的结构和相互作用的跨越。其次，大模型赋能生命科学不仅在降本增效，还在于创新创造。大模型对千行百业的赋能核心就在于降本增效，同样在生命科学领域，大模型可以快速处...……更多
2024-11-07 09:50:00模型,重构,生命科学,序列,生命,基础
...的致病性的预测4. 模型——建模复杂系统及其组件之间的相互作用1960年，诺贝尔奖得主物理学家Eugene Wigner感叹数学方程在模拟自然现象（如行星运动）中「出乎意料的有效性」。但面对生物学、经济学、天气等复杂系统，传统...……更多
2024-11-27 18:23:00科学家,实验室,科研,指数,实验,科学
...可以预测蛋白质、DNA、RNA等生物分子的结构以及它们如何相互作用。Alphabet兼谷歌CEO Sundar Pichai表示，目前，已有180多万名研究人员在疫苗开发、癌症治疗等研究工作中使用AlphaFold进行蛋白质预测。在接受采访时，Isomorphic Labs的CE...……更多
2024-05-09 22:27:00巨头,落地,制药,多家,药物,英伟
...这种方法能够更准确地理解蛋白质在细胞内复杂环境中的相互作用，从而增加研发有效药物的可能性。此外，Belharra公司使用非共价分子探针库扫描他们发现的所有蛋白质表面，这项技术能使研究人员以更精确的方式去研究那些...……更多
2024-02-19 06:42:00十家,公司,蛋白,药物,蛋白质,公司
...健康大脑衰老过程中所必需的基因，不仅能与反转录因子相互作用，并且它的表达也和年龄的变化非常相关。需要说明的是，这里的反转录因子作为一种异源五聚体复合物，是跨膜蛋白和脂质从内体循环到跨高尔基网络或细胞膜...……更多
2024-02-18 09:58:00长寿,因子,衰老,科学家,大脑,调节
...打开了新方向。对于通过调节肠道菌群与肠道补体之间的相互作用来治疗肠道感染、炎症性肠病和克罗恩病来说，这一研究也能为其提供新的预防思路和治疗思路。（来源：Cell）“古老”的补体系统及肠道菌群作为一种古老的...……更多
2024-03-11 10:19:00肠病,补体,肠道,面纱,科学家,治疗
...子之间复合物的结构，以及大分子、小分子和离子之间的相互作用。诺贝尔化学奖委员会主席海纳·林克表示：“今年获得认可的发现之一与神奇蛋白质的构造有关。另一项发现则与实现50年前的梦想有关：根据氨基酸序列预测...……更多
2024-10-09 19:41:00诺贝尔化学奖,诺贝,蛋白质,蛋白,科学家,密码
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