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文/庄时利和 科普作家,凤凰网《肿瘤情报局》特约专家
核心提要:
1. 2022年8月31日,“德尔塔克戎”毒株首次在南非发现。“德尔塔克戎”毒株,国际分类命名为XAY.2。1月6日,泰国卫生部证实检出该国首例此型毒株。1月19日,中国疾控中心研究院表示:中国尚没有检测出德尔塔克戎变异株,且目前没有关于该病毒的足够数据。
2. 一项发表在medrxiv的研究表明,德尔塔克戎在与奥密克戎的竞争中似乎没有优势。世卫组织发言人克里斯蒂安·林德迈尔也在1月18日表示,基于有限的数据,XAY.2变异株目前尚未被观察到有明显的生长优势,也未展现出更强的免疫逃逸能力和更严重的致病能力,针对其他新冠病毒变异株的保护措施也可适用于对该变异株的防护。
3. 德尔塔克戎的疫苗抵抗特性可能更接近于奥密克戎,并且按照德尔塔克戎的样本上升速度,它不太可能在全球范围内产生重大影响。新冠病毒的重组本身是意料之中的事情,这次泰国的德尔塔克戎是值得监测的变异体,将来也可能会有更多出来。目前大家并不需要为之恐慌,这次的病毒变异株可能是昙花一现。
春节前,又来了个新毒株:德尔塔克戎?!
1月6日,泰国卫生部证实,该国检出首例“德尔塔克戎”毒株,该毒株是奥密克戎变异株BA.4、BA.5和德尔塔变异株AY.45的重组体,国际分类命名为XAY.2。该毒株于2022年8月31日首次在南非发现,目前在全球9个国家和地区监测到。2022年12月以来,以丹麦为主的极少数国家呈升高趋势。1月19日,中国疾控中心传防处研究员常昭瑞表示,目前中国尚没有监测到“德尔塔克戎”变异株。目前还没有关于该病毒传播力、致病力和免疫逃逸能力等方面的足够数据。
该消息引发不少关注,有媒体发出“双毒合璧再升级?”的疑问,也有不少声音关注该毒株可能对中国国内疫情产生何种影响。
公众担忧新型毒株输入会引发新的感染,德尔塔克戎变异株和德尔塔有关系吗?我们是否需要担心?
新冠病毒的突变/ 基因重组怎么回事?为什么会不断变异?
先讲讲一些基础知识。
新冠病毒本身的结构往简单里说,就是核酸加上外面一个蛋白质外壳。而新冠病毒的蛋白质又分为结构蛋白(structure protein)和非结构蛋白(nonstructure protein,缩写就是nsp)两部分。
结构蛋白就是我们听得比较多的刺突蛋白S、包膜蛋白E、膜蛋白M和核衣壳蛋白N这四种,它们是构成病毒颗粒所必须的蛋白质,而非结构蛋白有十几种,它们是病毒基因组编码的、在病毒复制过程中具有一定功能,但是不结合于病毒颗粒中的蛋白质。
咱们要是把新冠病毒的RNA拍扁了,就会发现很长的一节ORF1a/b基因,然后较长一节S基因。我相信很多人都有做过核酸检测(RT-PCR),核酸检测的最重要靶序列之一就是新冠病毒相对保守的ORF1a/b区域,几个变异体的突变都不影响核酸检测。
▎图/世界卫生组织发言人克里斯蒂安·林德迈尔1月18日接受媒体采访时表示,自2022年8月31日至2023年1月17日期间,全球流感共享数据库(GISAID)共接到来自不同国家提交的共456例XAY.2样本。基于有限的数据,XAY.2变异株目前尚未被观察到有明显的生长优势,也未展现出更强的免疫逃逸能力和更严重的致病能力,针对其他新冠病毒变异株的保护措施也可适用于对该变异株的防护。
▎图/新冠疫情初起以来,病毒已经发生了成千上万次大大小小的突变.病毒变异将演变到什么程度,目前很难预测,因为不光是变异毒株的数量,还涉及传染性、危害力、免疫的有效时间长短等各种因素。
遏制新冠病毒变异毒株层出不穷的最有效办法,就是减少全球新冠病毒感染病例,因为每次新的感染就是病毒发生变异改变行为的机会。
新冠病毒为什么会突变?
接下来,咱们再说说新冠病毒的突变/ 基因重组是怎么回事。
用流感病毒举例说明。
流感病毒的突变是过去研究得比较多的。和新冠所属的冠状病毒不同,流感病毒会通过抗原漂移(antigenic drift)和抗原转换(antigenic shift)的方式发生改变。
▎图/奥密克戎 —— 当前各种变体之母奥密克戎变异株最初于11月11日在南非邻国博茨瓦纳首次发现,3天后,14日,南非记录了全球首个B.1.1.529感染病例。11月25日,南非国立传染病研究所宣布确认这一最新变异毒株,称这种变异株具有高感染力和疫苗难以起作用的免疫逃避风险。
WHO 11月26日将Omicron (奥密克戎)列入“值得关切”变异毒株。据南非流行病应对和创新中心主任图利奥·德奥利维拉(Tulio de Oliveira)教授在11月一次吹风会上介绍说,总共有 50 种突变,刺突蛋白有 30 多种突变。刺突蛋白是病毒借以侵入人体细胞大门的钥匙,也是大部分疫苗针对的标靶。奥密克戎被认为是迄今为止突变最多、程度最深的变异毒株,与原始新冠病毒和之前流行的主要变异株差别非常大。
流感病毒的基因组由8个独立的RNA片段组成。简单来说,抗原漂移是流感病毒在复制过程中,随机出现的复制错误(点突变)逐渐累积起来,导致表面抗原改变;而抗原转换是两种不同类型的流感病毒在同时感染一个个体时,基因组出现交换和重配(reassortment)引起的巨大变化。
抗原漂移是流感病毒基因的微小变化,导致病毒表面蛋白的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的改变(你听过的什么H1N1、H7N9,指的就是这俩糖蛋白的不同)。当抗原漂移不断累积,我们的免疫系统可能无法识别抗原并预防新的流感病毒造成的疾病。
而抗原转换的概率比抗原漂移低很多。它是甲型流感病毒发生巨大变化,由两种(或多种)不同的甲流病毒株重配产生全新的病毒株。而大多数人对抗原转换产生的新病毒没有抵抗力,这有可能会导致流感大流行,比如2009年的H1N1,这个毒株是四种不同毒株(人类、禽类、北美猪和欧亚猪)重配产生的产物。
甲型流感病毒会发生抗原漂移和转换,也是唯一一种会引起大流行的流感病毒,而乙型流感病毒只会发生抗原漂移。简而言之,流感病毒的这两个机制,是为什么我们每年要更新流感疫苗以及流感可能出现大流行的主要原因。在过去的一个多世纪里,甲流在全球一共出现四次全球大流行。
就像上面所说,新冠病毒所属的冠状病毒,其突变速度低于大多数其他RNA病毒,尤其是甲流病毒。而冠状病毒的基因组不像流感病毒有分段,它是单一一段很长的RNA组成,当两种冠状病毒同时感染时,它们可能会发生重组(recombination)而不是重配,但也可能产生新的病毒——比如新冠病毒。
所以新冠病毒不同变异体之间的重组是存在的,重要的是找出证据证明这一点,并且分析重组后的毒株特性。
▎图/据泰国卫生部医学厅副厅长在公开的讲话中称,感染XAY.2的人没有经历严重的症状反应,并且已经从该疾病中恢复过来。他补充称,初步资料显示XAY.2的症状不严重,并且疫苗已显示出对其的防护作用。泰国卫生部称,该部门已经向全球流感共享数据库(GISAID)分享了XAY.2病例有关的信息。
德尔塔克戎变异株和德尔塔有关系吗?“德尔塔克戎”目前并不是一个正式的命名
关于Omicron和Delta的重组,很多人会提到一月份塞浦路斯的研究,实际上那个研究很可能是实验室污染出现的问题(污染导致的PCR重组),根据在nextstrain上传的样本测序结果,24例Delta都没有单系来源。
我们回到这次泰国检出的德尔塔克戎,先说一点,“Deltacron”并不是一个正式的命名,在研究中也没有用这个名字。这项研究发表在medrxiv上,标题是“Evidence for SARS-CoV-2 Delta and Omicron co-infections and recombination”。从标题中我们可以知道研究人员发现了两点,第一是这两种变异体的共感染(co-infections),第二是它们之间的重组。
研究人员对2.9万个感染病例的样本进行了测序,最终发现了20例共感染,并且有2例出现了Delta和Omicron的重组。
德尔塔克戎的传染性、毒性以及对疫苗药物的影响如何?它不太可能在全球产生重大影响
人们最关心的应该是,Deltacron的传染性、毒性以及对疫苗药物的影响如何?目前的重组病毒还是非常有限的,但是我们可以发现一点,它们的S蛋白主要是来自于Omicron,而S蛋白是新冠病毒与人体细胞的结合位点,也是疫苗的靶点,也就是说,Deltacron的疫苗抵抗特性,可能更接近于Omicron。
这个变异体是需要监控的, 但是这项研究的第一作者Alexandre Bolze也表示,目前只检测到2个Deltacron(在2.9万个样本中),表明它在与Omicron的竞争中似乎没有优势。我们可以回想一下,真正有竞争力的变异体(比如Delta和Omicron)当时成为主流变异体有多迅速,而按照Deltacron的上升速度,它不太可能在全球范围内产生重大影响。
最后,我们总结一下,新冠病毒的重组本身是意料之中的事情,这次泰国的Deltacron是值得监测的变异体,在将来也会有更多的研究出来。
春节期间,泰国是国内游客的重要旅游地,这种变异株在国内迟早会出现,但是目前大家并不需要为之恐慌。
因为它很可能会像之前发现的众多的突变株一样,成为昙花一现的流星。
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快照生成时间:2023-01-20 09:45:07
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