康熙擒拿了鳌拜，彻底收回了皇权，开始了辉煌的帝王生涯

康熙除掉鳌拜之后，就开启了康熙盛世的统治，他先后进行了平三藩和收台湾等重大决策，这其中也都有福全参与其中，福全也确实如他幼年所说愿为贤王，他为弟弟康熙的丰功伟绩进言献策，可以说康熙前中期福全对他的贡献非常大，也因此康熙对哥哥福全尤为信任喜爱和敬重礼遇，但直到平定噶尔丹时，康熙开启了猜忌哥哥福全的之路。

准噶尔部是卫拉特蒙古四大部落之一，准噶尔部后来在首领噶尔丹的统治下日益强盛并逐渐称霸中亚，随着实力的强盛，噶尔丹野心也日益张狂，他早在康熙二十七年(1688年)时，就勾结沙俄，企图制造清代分裂，侵占蒙古喀尔喀部。

到了康熙二十九年(1690年)葛尔丹又再度得寸进尺，侵占内蒙古等地区，此前康熙忙于平定三藩叛乱，后来又收复台湾，连年征战已经让国库日渐空虚，因此康熙一直对噶尔丹睁只眼闭只眼，只要噶尔丹不侵扰清代边境就可以与其相安无事，但噶尔丹入侵内蒙等地区，其意图很明显就是准备要入侵清代，因此康熙忍无可忍。

康熙在与哥哥福全和王公贵族商议之后决定亲征噶尔丹，康熙既然决定御驾亲征，也想来一把打虎亲兄弟，于是他任命哥哥福全为抚远大将军率大军出古北口进攻噶尔丹，命弟弟常宁为安北大将军出喜峰口攻打噶尔丹，康熙本人率部坐镇博洛和屯(今内蒙古正蓝旗南)。

这是康熙第一次亲征噶尔丹，这一次康熙还特意带上了已经年满十八岁的大儿子胤禔出征，并让胤禔跟随福全大军出征。

胤禔在行军过程中屡有失误，这让福全对其比较不满，但福全生性宽厚随和，并没有当即对胤禔发作，而是隐忍下来。

在征讨噶尔丹时，最先抵达战场的是常宁，当时常宁所部大军于现今内蒙古锡林郭勒盟乌珠穆沁草原一带与噶尔丹部所遇，由于常宁大军战线拉得比较长，因此军需补给不到位，常宁的大军与噶尔丹一战即溃。

常宁战败后一路向南撤退，随即与抵达战场的福全大军相遇，福全与常宁合兵一处与噶尔丹在沙拉木伦河上流高凉河一带展开大战，噶尔丹的大军敌不过福全和常宁兄弟的两路联军，于是噶尔丹逐渐不支败退，康熙算准噶尔丹要败，因此他又命堂兄康亲王杰书率精兵进驻归化(现今内蒙古呼和浩特)阻断噶尔丹的归路。

噶尔丹由于归路被断，于是他就在乌兰布通(现今内蒙古赤峰克什克腾旗西南部)屯驻下来，决意与清军背水一战，因此福全和常宁联军在乌兰布通与噶尔丹展开了大决战，这一战史称“乌兰布通之战”。

这一战使得噶尔丹战败，其大军伤亡惨重，但清军也是同样伤亡惨重，这一战让满清不少王公贵族阵亡，其中连康熙的亲舅舅佟国纲都于此战中阵亡，但结果非常不错，福全指挥清军对阵噶尔丹大获全胜，噶尔丹战败逃亡。

噶尔丹战败后十分狡猾，他担心被福全大军追击上，于是采取了缓兵之计，他假意向福全投降，并上书康熙承认自己罪责，以投降认罪的态度迷惑了福全和康熙，不过康熙毕竟十分冷静，他一再告诫福全要防备好噶尔丹，认为噶尔丹十分狡诈，不可全信，也不能让他脱离福全的掌控范围。

但是福全还偏偏中了噶尔丹的缓兵之计，以致噶尔丹有了喘息之机，趁机逃出了清军包围圈。福全得知噶尔丹逃跑出包围圈后，并不想继续穷追不舍，主要当时福全大军粮草已断，军粮只剩十余天，而且噶尔丹虽然战败逃跑，但其部还有一万余准噶尔部精锐骑兵，如果噶尔丹在穷途末路之下做殊死一搏，乌兰布通之战就已经非常惨烈，很多王公贵族在此战阵亡，而福全此时还带着皇长子胤禔，万一胤禔在战场上再有损失，他如何向弟弟康熙交代。所以最后福全在没有请示康熙命令的情况下，擅自做主命常宁与自己一同退军。