毛里孩深入六州县，抢掠而去，兵部因此劾项忠，但获得宪宗原宥

明成化四年(1468年)，满俊反叛，满俊别名满四，满俊的先祖巴丹，自明朝初期带领下属归顺朝廷，世世代代统领千户的游牧部落。沿用以往俗规，无捐税徭役。其地在开城县的固原里，接着边境。满俊蛮横无理，向来收藏坏人盗贼，经常出现边境线抢掠。正好有纠纷案拖累满俊，有关部门跟踪赶到他的家，多方面索求，满俊发火，因此扇动部众造反。守臣外派满俊侄子指挥满王寿前去抓捕。满俊干掉满王寿的仆从，劫持满王寿反叛，进入石城据守。

项忠就与巡抚都御史马文升分兵七路，到达石城外，与满军对战，杀敌和战俘敌人许多，伏羌伯毛忠乘胜攻其西北山，几乎攻克，突然中箭而死。刘玉也被包围。诸军想退，项忠斩一千户长示众，部队士兵竭尽全力拼战，刘玉终能得救，因此项忠布兵围住敌方。项忠每日出兵迫近城外，焚烧处理牲口饲草，断决其引水的方式。叛贼无路可走想撤兵，就邀约与项忠、马文升相见，项忠同刘玉两个人骑着马见面，马文升也带上几十骑兵队到，叫喊满俊、满王寿快速投降。叛贼远远的望到罗列而拜，项忠单骑往前挟制满王寿回到，满俊十分沮丧，犹豫着不出来。项忠指令士兵将木头扎成桥，用土袋补平环城河和濠沟，以铜炮发石块进攻，叛贼死伤更为惨痛。项忠领兵快速占领石城，将城里余寇全部虏获。端掉这座城，在石块上印字记下军功。在固原西北西安市废城增加一个卫所，留有部队戍守后，项忠率军而还。由于军功，升为右都御史，与林聪协同负责院事。

白圭已经平定刘通，荆州市、武汉地域的流民集聚如故。刘通党羽有叫李胡子的人，名称叫李原，伪称平王，与小王洪、王彪等打劫南漳、房县、内乡、渭南各县市。流民归顺李贼的已到上百万人。明成化六年(1470年)冬天，朝廷下谕旨任项忠为总督军务，与湖广总兵官李震一同征讨李原，项忠上奏折请调永顺、保靖士兵。项忠命令副使余洵、都指挥李振进攻，在竹山两军相逢，溪水增涨，乘贼过河过去了一半进行截击，捉拿李原、小王洪等，贼被溺亡许多。项忠将部队迁移到竹山，捕获余孽，又招来流民五十万，斩首六百四十，俘获八百多敌人，家眷人口数量三万余人。每一户选一男丁，守护湖广边境线，其他的回归户籍地分田耕地。项忠上疏阐述善后处理十件事，朝廷统统准许推行。

项忠下令驱逐流民，相关部门则一律逼迫驱逐。如不走，就杀掉。流民中有自洪武年间就自异地迁来，已变成有户口的本地住户，也在被遣返中。守边的流民坐船中途病亡许多。给事中梁王景借着朝廷由于星相转变广开言路之机，弹劾项忠随意杀人，白圭也说流民早已立业的，应随所在地落户口，又反驳项忠所报功的等次相悖，明宪宗都不听，升项忠为左都御史，荫庇儿子项绶为锦衣千户，对诸将按等级记录贡献。

汪直开西厂，放纵蛮横无理，项忠频繁遭受汪直的污辱不堪承受，恰好大学士商辂等弹劾汪直，项忠也领着九卿弹劾汪直，皇上将罢免汪直的奏折留到宫里不加处理，可是西厂还是停办，汪直心里十分憎恨项忠等，不久，西厂又恢复，汪直用吴绶为亲信，吴绶心揣前仇，更为迫不及待地找寻项忠的错漏，以资对付。项忠心里躁动不安，要求回乡看病，还未成行，而吴绶教唆侦探的人诬陷项忠犯法。给事中郭镗、御使冯贯等又上奏折弹劾项忠，事情拖累项忠的儿子项经、太监黄赐、兴宁伯李震、彰武伯杨信等。宪宗下诏由法司会与锦衣卫在朝廷审问，项忠大声争论一点也不妥协，然而许多人了解这一切源于汪直的意向，没有人敢为他辩解，竟将项忠削职为民，黄赐与李震等也被判罪。汪直倒台后，项忠恢复官衔，后辞官返乡，在家居二十六年，到弘治十五年(1502年)，过世，寿终八十二岁。追授太子太保，谥号襄毅。